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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

河北新增 5 个“河北省历史文化街区”******url:https://m.gmw.cn/2023-01/03/content_1303243006.htm,id:1303243006

　　记者从河北省住房和城乡建设厅获悉，近日，河北省人民政府批复唐山、衡水市政府关于申报历史文化街区的请示，同意开滦唐山矿、启新水泥厂、培仁、冀州老街、直隶六师（旧址）街区为河北省历史文化街区。至此，" 河北省历史文化街区 " 数量达到 37 个。

　　批复指出，唐山、衡水要加快历史文化街区保护规划的编制、审批和备案工作，科学划定核心保护范围和建设控制地带，明确保护原则和保护重点，制定相应保护控制措施。要切实做好历史文化街区保护传承工作。对批准的历史文化街区实施挂牌保护，着力保护好街区的历史肌理、历史街巷、空间尺度和景观环境，以及古井、古桥、古树等环境要素，延续历史风貌。加强建设活动管控，强化保护修缮全过程管理。强化整体保护，整治与街区环境不协调的建筑和景观，完善基础设施，提升居住环境。要积极推进历史文化街区的活化利用。坚持以用促保，依托街区的历史环境，加大文物开放力度，利用具备条件的文物建筑作为博物馆、陈列馆等公共文化设施，活化利用历史建筑、工业遗产，引入和丰富商业业态，完善生产生活功能，让历史文化和现代生活融为一体，实现永续传承。

　　文/燕赵晚报融媒体记者 陈霞

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）